По возвращении перешел в МДА на экстернат и начал преподавать древнегреческий язык при Греко-латинском кабинете МДАиС (2001-2013).
21 апреля 2000 г. пострижен в монашество с наречением имени Леонтий в честь святителя Леонтия Ростовского, 26 апреля рукоположен в сан иеродиакона.
9 марта 2003 г. ректором Московской духовной академии архиепископом Верейским Евгением рукоположен в сан иеромонаха.

В 1991 г. поступил в Московский авиационный технологический институт (МАТИ) на специальность техник-технолог авиационных двигателей, где проучился три полных курса. но в 1994 г. подал документы на поступление в Московскую духовную семинарию.

В 1995-1999 гг. обучался в Московской духовной семинарии, в 1999-2003 гг. — в Московской духовной академии. С октября по июнь 2000 г. обучался новогреческому языку в Патрском университете в Греции.